Chromiumシングルセル

エピマルチオームATAC + 遺伝子発現解析

同一核のオープンクロマチンと3'遺伝子発現についてシングルセルプロファイリングを実施

シングルセルの専門家に相談

1万核/サンプル、8万核/チップ

8サンプルを並行して解析

エピマルチオームATAC + 遺伝子発現解析を使用する理由

    同じ核からの遺伝子発現情報とオープンクロマチン情報を直接リンクさせる
    新しい遺伝子制御相互作用の発見を目指す

アッセイの仕様

対応する生物種

マウス
ヒト
ラット
非ヒト霊長類
海洋生物
植物
昆虫

対応するサンプルの種類

細胞懸濁液
核懸濁液
新鮮組織
凍結組織
オルガノイド

マルチオミックス機能

クロマチンアクセシビリティ
3' 遺伝子発現

互換性のある装置

Chromium X

ラン構成

シングルプレックス

1万核/サンプル
8万核/チップ
8サンプル/チップ

アッセイ構成要素

個々の実験に必要なのは、チップ、インデックスキットおよびコア試薬ですが、オプションでバーコード化キットを使用できます。必要なものが不明な場合は、実験ビルダーをご使用ください。お客様の実験に必要な品目のリストを作成できます。

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Consumables

Nuclei Isolation (optional)

REAGENT

1000494

Chromium Nuclei Isolation with RNase Inhibitor Kit, 16rxns

Chip

CHIP

1000230

Chromium Next GEM Chip J Single Cell Kit, 16 rxns

CHIP

1000234

Chromium Next GEM Chip J Single Cell Kit, 48 rxns

Index Kit

REAGENT

1000215

Dual Index Kit TT Set A 96 rxns

REAGENT

1000212

Single Index Kit N Set A, 96 rxn

Core Reagents

REAGENT

1000285

Chromium Next GEM Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression Reagent Bundle, 4 rxns

REAGENT

1000283

Chromium Next GEM Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression Reagent Bundle, 16 rxns

Compatible Instruments


Product sheet

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Sample prep

Vサンプル調製リソース

Sequencing requirements

20,000ペアリード/核で遺伝子発現解析。25,000ペアリード/核でATAC解析

シーケンシングのリソース

ビデオ

ヒストンメチル化標的療法の作用機序と抵抗性

Nature, 2024

Makoto Yamagishi, et al.

PubMedリンク

シングルセルシステムは、その薬理学的機能により、B細胞急性リンパ性白血病における発現促進型医薬品反応および併用療法を特定する

Cancer Cell, 2024

Xin Huang, et al.

PubMedリンク

皮質介在ニューロン発現の遺伝的協調およびエピジェネティックな協調

Nature, 2021

Kathryn C Allaway, et al.

PubMedリンク

ヒト脳オルガノイド内の細胞運命レギュロームの推量と摂動

Nature, 2022

Jonas Simon Fleck, et al.

PubMedリンク

多様なリプログラミングレギュラトームを比較することで、 Ascl1の交差系統の可能性を明らかにする

Cell Stem Cell, 2022

Haofei Wang, et al.

PubMedリンク

マルチオミックス統合による神経科学アプリケーションノート:シングルセルマルチオームRNA + ATACにより、アルツハイマー病マウスモデルの脳冠状断面をひとつの大脳半球から採取し、経時的に評価

データセット

Human Kidney Cancer Nuclei isolated with Chromium Nuclei Isolation Kit, SaltyEZ Protocol, and 10x Complex Tissue DP (CT Sorted and CT Unsorted)

データセット

Flash-Frozen Lymph Node with B Cell Lymphoma (14k sorted nuclei)

データセット

10k Human PBMCs, Multiome v1.0, Chromium X

データセット

Flash-Frozen Human Healthy Brain Tissue (3k)

データセット