Chromiumシングルセル

遺伝子発現Flex

GEM-Xテクノロジーを用いたプローブベースのアッセイで18,000以上のコーディング遺伝子をキャプチャー。プロジェクトのニーズに合わせてカスタマイズ可能

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難しいサンプルでもきわめて高い性能

推奨細胞スタート数を25,000個に減少

遺伝子発現Flexを選択する理由

    保存検体や品質の低いサンプルを使用
    柔軟なサンプルバッチ処理が必要
    大規模プロジェクトの場合、コストは細胞あたり1セント未満

アッセイの仕様

対応する生物種

マウス
ヒト
カスタムプローブで他の生物種に対応

対応するサンプルの種類

細胞懸濁液
核懸濁液
新鮮組織
凍結組織
FFPE組織
PFA固定組織
FACSソート細胞
固定全血
オルガノイド

マルチオミックス機能

プローブベースの遺伝子発現
細胞表面タンパク質
細胞内タンパク質
CRISPRスクリーニング

互換性のある装置

Chromium X

ラン構成

シングルプレックス

20K cells/sample
16万細胞/チップ
8サンプル/チップ

インラインサンプルマルチプレキシング

20K cells/sample
256万細胞/チップ
128サンプル/チップ

アッセイ構成要素

個々の実験に必要なのは、チップ、インデックスキットおよびコア試薬ですが、オプションでバーコード化キットを使用できます。必要なものが不明な場合には、実験ビルダーをご使用ください。お客様の実験に必要な品目のリストを作成できます。

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Consumables

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Nuclei Isolation (optional)

REAGENT

1000494

Chromium Nuclei Isolation with RNase Inhibitor Kit, 16rxns

Sample Prep Kit

REAGENT

1000781

GEM-X Flex Sample Preparation v2 Kit, 48 rxns

Individual Wash Workflow (optional)

REAGENT

1000828

GEM-X Flex Supplemental Wash Kit, 64 rxns

Chip

CHIP

1000791

GEM-X Flex Gene Expression Chip Kit, 4 chips

Index Kit

REAGENT

1000251

Dual Index Kit TS Set A, 96 rxn

REAGENT

1000215

Dual Index Kit TT Set A 96 rxns

Core Reagents

REAGENT

1000792

GEM-X Flex Gene Expression Human, 4 samples

REAGENT

1000793

GEM-X Flex Gene Expression Human 4-plex, 16 samples

REAGENT

1000794

GEM-X Flex Gene Expression Human 16-plex, 64 samples

REAGENT

1000829

GEM-X Flex Gene Expression Human n-plex, 64 samples

REAGENT

1000795

GEM-X Flex Gene Expression Human 16-plex, 256 samples

REAGENT

1000796

GEM-X Flex Gene Expression Mouse, 4 samples

REAGENT

1000797

GEM-X Flex Gene Expression Mouse 4-plex, 16 samples

REAGENT

1000798

GEM-X Flex Gene Expression Mouse 16-plex, 64 samples

REAGENT

1000831

GEM-X Flex Gene Expression Mouse n-plex, 64 samples

REAGENT

1000799

GEM-X Flex Gene Expression Mouse 16-plex, 256 samples

Feature Barcoding Kit (optional)

REAGENT

1000628

Fixed RNA Feature Barcode Multiplexing Kit, 64 rxns

Compatible Instruments


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Sample prep

サンプル調製リソース

Sequencing requirements

最低細胞あたり10,000ペアリードで遺伝子発現解析。細胞あたり5,000ペアリードでタンパク質解析

シーケンスのリソース

ビデオ

注目論文

Flexの文献

シングルセルシステムは、その薬理学的機能により、B細胞急性リンパ性白血病における発現促進型医薬品反応および併用療法を特定する

Cancer Cell, 2024

Xin Huang, et al.

PubMedリンク

ペルオキシソームの欠損は、重症ツェルウェーガー症候群のモデルにおいて肝免疫細胞が発現されず抗原が提示されない理由である

Cell Reports, 2024

Brendon D Parsons, et al.

PubMedリンク

長い軸索投射を持つ皮質ソマトスタチンニューロンおよび介在ニューロンの発現経路は多様である

Neuron, 2023

Josephine Fisher, et al.

PubMedリンク

注目データセット

すべてのFlexデータセット

10k Mouse Forebrain FFPE Tissue Dissociated using gentleMACS Dissociator, Singleplex Sample

データセット

Aggregate of ~900k Human Non Small Cell Lung Cancer and Normal Adjacent Cells, Multiplexed Samples, 16 Probe Barcodes

データセット

128k Human PBMCs Stained with TotalSeq™-C Human Universal Cocktail

データセット

Human Ovarian Cancer FFPE Single Cell Gene Expression Flex

データセット

Aggregate of Human PBMC Isolated from Fixed Whole Blood of a Diseased Donor and a Healthy Donor

データセット