Chromiumシングルセル
エピマルチオームATAC + 遺伝子発現解析
同一核のオープンクロマチンと3'遺伝子発現についてシングルセルプロファイリングを実施
1万核/サンプル、8万核/チップ
8サンプルを並行して解析
エピマルチオームATAC + 遺伝子発現解析を使用する理由
アッセイの仕様
対応する生物種
マウス
ヒト
ラット
非ヒト霊長類
海洋生物
植物
昆虫対応するサンプルの種類
細胞懸濁液
核懸濁液
新鮮組織
凍結組織
オルガノイドマルチオミックス機能
クロマチンアクセシビリティ
3' 遺伝子発現互換性のある装置
ラン構成
シングルプレックス
1万核/サンプル
8万核/チップ
8サンプル/チップアッセイ構成要素
個々の実験に必要なのは、チップ、インデックスキットおよびコア試薬ですが、オプションでバーコード化キットを使用できます。必要なものが不明な場合は、実験ビルダーをご使用ください。お客様の実験に必要な品目のリストを作成できます。
Consumables
Nuclei Isolation (optional)
1000494
Chromium Nuclei Isolation with RNase Inhibitor Kit, 16rxns
Chip
1000230
Chromium Next GEM Chip J Single Cell Kit, 16 rxns
1000234
Chromium Next GEM Chip J Single Cell Kit, 48 rxns
Index Kit
1000215
Dual Index Kit TT Set A 96 rxns
1000212
Single Index Kit N Set A, 96 rxn
Core Reagents
1000285
Chromium Next GEM Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression Reagent Bundle, 4 rxns
1000283
Chromium Next GEM Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression Reagent Bundle, 16 rxns
資料とリソース
製品シート
ユーザーガイド
解析ガイド
予算申請用資料
ビデオ
仕組みのビデオ
単一細胞レベルの解像度で、トランスクリプトームとエピゲノムのプロファイリングを同時に実施
ヒト脳オルガノイドのシングルセルマルチオミックスプロファイリングによる脳発生の解明
高度にマルチモーダルな単一細胞の測定
大規模なDeep Immune Profiling：トリモーダル同時測定に使用する効率的なパイプラインとTEA-seq
データ解析
Cell Ranger ARC
Cell Ranger is a set of free analysis pipelines for processing Chromium Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression data
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注目論文
シングルセルシステムは、その薬理学的機能により、B細胞急性リンパ性白血病における発現促進型医薬品反応および併用療法を特定する
Cancer Cell, 2024
Xin Huang, et al.
注目データセット
マルチオミックス統合による神経科学アプリケーションノート：シングルセルマルチオームRNA + ATACにより、アルツハイマー病マウスモデルの脳冠状断面をひとつの大脳半球から採取し、経時的に評価
データセットヒト腎臓がんの核（Chromium Nuclei Isolation Kit、SaltyEZプロトコル、10x Complex Tissue DPを使用して分離、CTソート済みおよびCTソートなし）
データセットB細胞リンパ腫を含む急速凍結リンパ節（14,000個のソート済み核）
データセット10,000個ヒト末梢血単核細胞（PBMC）、Multiome v1.0、Chromium X
データセット急速凍結された健常なヒト脳組織（3,000個）
データセット関連製品
遺伝子発現Flex
GEM-Xテクノロジーを用いたプローブベースのアッセイで18,000以上のコーディング遺伝子をキャプチャー。プロジェクトのニーズに合わせてカスタマイズ可能
ユニバーサル 5' 遺伝子発現
免疫多様性を解析するGEM-Xテクノロジーを用いたRTベースのアッセイ
ユニバーサル 3' 遺伝子発現
トランスクリプトーム全体をキャプチャーし、多様な生物種から広範な情報を収集するGEM-X技術を用いたRTベースのアッセイ
エピ ATAC
オープンクロマチンのシングルセルプロファイリング