Chromiumシングルセル

最も汎用性の高いシングルセルツールキット

Chromium Single Cell
最もパワフルな2つのケミストリー

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概要
Gene expression

ユニバーサル (3’ / 5’)

逆転写ベースで全トランスクリプトームをカバー

  • 広範囲のマルチオームオプションと多様な生物種との適合性
  • アイソフォームキャプチャー、long non-coding RNAなど
  • 少量のサンプルからの高い細胞回収率
Gene expression

Flex

18,000以上のコーディング遺伝子のプローブベースの検出

  • 固定組織、全血など、これまで解析できなかったサンプルにアクセス
  • FFPEサンプルや低品質サンプルでも安定した性能
  • 最大のスケールおよびマルチプレキシング:最大256万細胞/ラン
製品
  • ユニバーサル 3' 遺伝子発現ユニバーサル 3' 遺伝子発現
  • ユニバーサル 5' 遺伝子発現ユニバーサル 5' 遺伝子発現
対応する生物種
  • 複数の生物種複数の生物種
  • ヒトヒト
  • マウスマウス
  • カスタムプローブで他の生物種に対応カスタムプローブで他の生物種に対応
対応するサンプル
  • 細胞懸濁液細胞懸濁液
  • 核懸濁液核懸濁液
  • フローソート細胞フローソート細胞
  • 固定ヒトPBMC固定ヒトPBMC
  • 新鮮組織新鮮組織
  • 凍結組織凍結組織
  • DSP/メタノール固定DSP/メタノール固定
  • オルガノイドオルガノイド
  • 細胞懸濁液細胞懸濁液
  • 核懸濁液核懸濁液
  • フローソート細胞フローソート細胞
  • 固定全血固定全血
  • 新鮮組織新鮮組織
  • 凍結組織凍結組織
  • FFPE組織FFPE組織
  • PFA固定組織PFA固定組織
  • オルガノイドオルガノイド
マルチオーム技術
  • 遺伝子発現解析遺伝子発現解析
  • BCR/TCRシーケンシングBCR/TCRシーケンシング
  • 抗原特異性抗原特異性
  • 細胞表面タンパク質細胞表面タンパク質
  • CRISPRスクリーニングCRISPRスクリーニング
  • クロマチンアクセシビリティクロマチンアクセシビリティ
  • 遺伝子発現解析遺伝子発現解析
  • 細胞表面タンパク質細胞表面タンパク質
  • 細胞内タンパク質細胞内タンパク質
  • CRISPRスクリーニングCRISPRスクリーニング
細胞・サンプルスループット

パイロット研究から中間スケール研究へ

シングルプレックス
2万細胞/サンプル
16万細胞/チップ
8サンプル/チップ
オンチップマルチプレキシング
5,000細胞/サンプル
4万細胞/チップ
最大4サンプル/流路出力:8サンプル/チップ
Output: 8 samples/chip
ハッシング
8流路/チップ
6万細胞/流路
48万細胞/チップ
出力:96以上のサンプル/チップ

最大のスケーラビリティ

シングルプレックス
2.5万細胞/サンプル
16万細胞/チップ
8サンプル/チップ
インラインマルチプレキシング
2.5万細胞/サンプル
256万細胞チップ
最大16サンプル/流路
出力:128サンプル/チップ
Epigenetics icon
細胞ごとにエピゲノムの全体像を解明
Epiキットを使用してシングルセルの解像度でクロマチンアクセシビリティを解析し、ゲノムワイドなエピジェネティックプロファイルを使用して細胞型および細胞の状態を解明。遺伝子制御メカニズムに関する理解を深める
Multiome assay

マルチオーム解析により同じ核の3’遺伝子発現とエピゲノムプロファイルを直接リンク

エピマルチオームについて知る
Use fresh, frozen, or fixed samples—even FFPE samples

チップあたり最大8万個の核(1~8サンプル)のプロファイリング。

Use fresh, frozen, or fixed samples—even FFPE samples

大半の組織について最適化がほとんど、または全く必要ない一体型の分離キットを使用することで、信頼性の高いアッセイ性能を確保

各抽出キットについて
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chromium
保存検体や品質の低いサンプルを使用
chromium
GEM-X Universal 3' 遺伝子発現
chromium
GEM-X Universal 5'遺伝子発現
保存検体や品質の低いサンプルを使用

全トランスクリプトーム遺伝子発現解析において、サンプル調製の柔軟性がきわめて高く、スケジュールに沿ってサンプルの固定、バッチ処理およびランを行えます

次のような実験には、Flexをお勧めします

  • 保存検体や品質の低いサンプルを使用

  • サンプルバッチ処理の柔軟性が必要

  • スケールアップの予定があり、細胞あたりのコストを低く抑える必要がある

詳細はこちらから
Build a Flex Experiment
GEM-X Universal 3' 遺伝子発現

3’遺伝子発現解析を行う多用途のソリューション(オプションでマルチオミック解析)

次のような実験には、3' 遺伝子発現をお勧めします

  • タンパク質同時発現の有無にかかわらず、全長トランスクリプトの情報が必要

  • 遺伝子発現のみが必要。または将来的にATACを使用する可能性あり

  • 必要細胞数が低い

GEM-X Universal 5'遺伝子発現

5’遺伝子発現解析とマルチオミックプロファイリングとを組み合わせた免疫多様性の包括的解析

次のような実験には、5'遺伝子発現をお勧めします。

  • タンパク質同時発現の有無にかかわらず、全長トランスクリプトの情報が必要

  • 今後、RISPRおよびTCR/BCRシーケンシングが必要になるか、選択肢に入るかもしれない

  • 必要細胞数が低い

Primary capability

プローブベースの遺伝子発現プローブベースの遺伝子発現

予め設計したプローブ(オプションとしてカスタムプローブ)を用いた遺伝子発現解析

3' 遺伝子発現3' 遺伝子発現

遺伝子3'末端付近のRNA分子を検出し定量

5'遺伝子発現5'遺伝子発現

遺伝子5'末端付近のRNA分子を検出し定量

Multiomic capabilities

細胞表面タンパク質細胞表面タンパク質

表面タンパク質マーカーを特定することで、細胞型とバイオマーカーをピンポイントに分類し、細胞のシグナル伝達および相互作用を探索する

CRISPRスクリーニングCRISPRスクリーニング

シングルセルの解像度レベルで細胞sgRNAと遺伝子発現の変化を直接捕捉してCRISPR摂動の影響を評価

細胞内タンパク質細胞内タンパク質

核タンパク質、細胞質タンパク質、分泌タンパク質など、細胞全体のタンパク質の検出を実現

細胞表面タンパク質細胞表面タンパク質

表面タンパク質マーカーを特定することで、細胞型とバイオマーカーをピンポイントに分類し、細胞のシグナル伝達および相互作用を探索する

細胞表面タンパク質細胞表面タンパク質

表面タンパク質マーカーを特定することで、細胞型とバイオマーカーをピンポイントに分類し、細胞のシグナル伝達および相互作用を探索する

CRISPRスクリーニングCRISPRスクリーニング

シングルセルの解像度レベルで細胞sgRNAと遺伝子発現の変化を直接キャプチャーしてCRISPR摂動の影響を評価

BCR/TCRシーケンシングBCR/TCRシーケンシング

全長のB細胞・T細胞ペア型受容体をキャプチャーすることで、クローンの増殖および多様性に関する知見が得られる

抗原特異性抗原特異性

適応免疫応答の詳細な特性を明らかにするために、免疫細胞受容体への抗原の結合を調べる

Compatible species

ヒト
ヒト
マウス
マウス
カスタムプローブで他の生物種に対応
カスタムプローブで他の生物種に対応
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ヒト
ヒト
マウス
マウス
ラット
ラット
非ヒト霊長類
非ヒト霊長類
海洋生物
海洋生物
植物
植物
昆虫
昆虫
その他
その他
ヒト
ヒト
マウス
マウス
非ヒト霊長類(TCR/BCRを除く)
非ヒト霊長類(TCR/BCRを除く)
ラット(TCR/BCRを除く)
ラット(TCR/BCRを除く)
その他
その他

Compatible sample types

細胞懸濁液
細胞懸濁液
核懸濁液
核懸濁液
新鮮組織
新鮮組織
凍結組織
凍結組織
FFPE組織
FFPE組織
PFA固定組織
PFA固定組織
FACSソート細胞
FACSソート細胞
固定全血
固定全血
オルガノイド
オルガノイド
細胞懸濁液
細胞懸濁液
核懸濁液
核懸濁液
新鮮組織
新鮮組織
凍結組織
凍結組織
固定ヒトPBMC
固定ヒトPBMC
FACSソート細胞
FACSソート細胞
オルガノイド
オルガノイド
細胞懸濁液
細胞懸濁液
核懸濁液
核懸濁液
新鮮組織
新鮮組織
凍結組織(遺伝子発現のみ)
凍結組織(遺伝子発現のみ)
固定ヒトPBMC
固定ヒトPBMC
FACSソート細胞
FACSソート細胞
オルガノイド
オルガノイド

Resolution

全細胞/核全細胞/核

Cells or nuclei are partitioned into GEM Gel Beads that uniquely barcode each, enabling single cell resolution

Learn about GEM-X Technology
全細胞/核全細胞/核

Cells or nuclei are partitioned into GEM Gel Beads that uniquely barcode each, enabling single cell resolution

詳細はこちらから
全細胞/核全細胞/核

Cells or nuclei are partitioned into GEM Gel Beads that uniquely barcode each, enabling single cell resolution

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Run configuration options

In-line multiplex
On-chip multiplexed
On-chip multiplexed

Compatible instruments

Chromium iX、XChromium iX、X

Chromium iXを用いて10x Genomicsのコアアッセイや技術をご利用になるか、Chromium Xを用いて10X Genomicsのシングルセルの全ポートフォリオをご活用ください

Discover the Chromium X Series
Chromium Xo、iX、 XChromium Xo、iX、 X

低コストのXo装置を使用して3'遺伝子発現を実施するか、Chromium iXを用いて10x Genomicsのコアアッセイや技術をご利用になるか、Chromium Xを用いて10X Genomicsのシングルセルの全ポートフォリオをご活用ください

Discover the Chromium X Series
Chromium iX、XChromium iX、X

Chromium iXを用いて10xGenomicsのコアアッセイや技術をご利用になるか、Chromium Xを用いて10X Genomicsのシングルセルの全ポートフォリオをご活用ください

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Included data processing & analysis software

Cell RangerCell Ranger

Cell Rangerは、シングルセルデータをお客様が処理できるように無料で提供する解析パイプラインです

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Cloud AnalysisCloud Analysis

迅速で簡単に結果が得られるように、最適化されたクラウドクラスター上で10xの解析パイプラインのランを実行するプラットフォーム

クラウド解析とは
Cell RangerCell Ranger

Cell Rangerは、シングルセルデータをお客様が処理できるように無料で提供する解析パイプラインです

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Cell RangerCell Ranger

Cell Rangerは、シングルセルデータをお客様が処理できるように無料で提供する解析パイプラインです

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Included interactive visualization tools

Loupe BrowserLoupe Browser

Loupe BrowserはWindowsおよびMacOS用のデスクトップアプリケーションです。データをインタラクティブに視覚化できます

Dive into Loupe Browser
Loupe BrowserLoupe Browser

Loupe BrowserはWindowsおよびMacOS用のデスクトップアプリケーションです。データをインタラクティブに視覚化できます

Dive into Loupe Browser
Loupe BrowserLoupe Browser

Interactively explore clonotype information and repertoire diversity alongside gene expression data in Loupe Browser.

Dive into Loupe Browser
Loupe V(D)J BrowserLoupe V(D)J Browser

Investigate clonotypes and examine V(D)J transcripts with this interactive visualization desktop software.

Download Loupe V(D)J

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