Chromium 核抽出

効率的なワークフローにより、複雑なサンプル調製を解消

シングル核シークエンシング用の凍結サンプルを簡単かつ効率的に調製し、実験プロセスを統合して、より多くのサンプルへのアクセスを改善します。Chromium遺伝子発現およびクロマチンアクセシビリティ(接近可能性)アッセイでの使用に最適化され、統一されたサンプル調製のワークフローにより、複数の組織タイプから信頼性の高い結果を確実に得ることができます。

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核抽出

Resources:

  • 今すぐ開始しましょう

    シングルセルシーケンスの専門知識は不要で、簡単に使用できます。

  • 時間と貴重なサンプルを節約

    組織の解離と核単離を最適化するために勘に頼る必要はありません。

  • 結果に自信を

    10x Genomicsシングルセルアッセイ用に設計された信頼性の高い標準化された試薬を用意しています。

真の組織組成の解析

新鮮な組織を解離する際に失われがちな細胞の特徴をそのまま保持することにより、組織の不均一性をより正確に解析できます。合理化された核抽出キットによって、長時間の酵素による遺伝子発現の変化を抑え、細胞型検出の偏りを防ぐことができます。

遺伝子制御のメカニズムを解明

核を用いて遺伝子発現とクロマチンアクセスの情報を獲得し、細胞分化、発生、および疾患を促進する遺伝子制御の相互作用を探ります。

サンプルの生物学的状態の維持

サンプルを時間内に凍結し、生物学的状態を維持します。遺伝子発現の変化を最小限に抑えながら、中央検査施設でのサンプル調製のためにサンプルを輸送したり、後に利用するために保管することができます。

保存されたサンプルへのアクセスを拡大

新しいシングルセル技術を用いてバイオバンク凍結組織を再評価し、これまで未解決だった科学的疑問に取り組むことができます。

実証済みの成果

Chromiumシングルセル核抽出キットの使用例をご覧ください。

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Chromiumシングルセル核抽出キットには、最新のアプリノートやその他の資料が用意されています。

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実証済みの成果

ビデオ

Chromiumシングルセル核抽出キットの使用例をご覧ください。

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参考資料

Chromiumシングルセル核抽出キットには、最新のアプリノートやその他の資料が用意されています。

腫瘍学における シングルセル アプリケーションのためのサンプル調製

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サンプル調製, 10x Genomics

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Sample preparation optimization guide with Single Cell Gene Expression LT

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Sample Preparation Guide, 10x Genomics

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Multiply your power of discovery, simplify your workflows

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Multiome/Nuclei Isolation Flyer, 10x Genomics

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エンドツーエンドソリューション

核の調製

オールインワンキットは、標準的な実験器具を使用し、特別な機械は必要ありません

シングルセルアッセイの選択

核を用いて、クロマチンアクセシビリティまたは全トランスクリプトーム遺伝子発現プロファイルを取得することができます。

直感的な解析・視覚化ソフトウェア

シングルセルの解析には、クラウドでのデータ処理、Cell Ranger解析パイプライン、10xの視覚化アプリであるLoupeをご用意しています。

世界トップクラスの技術とカスタマーサポート

専門サポートチームに、電話またはメールでお問い合わせいただけます。

ワークフロー

下にスクロールして、Chromium核抽出の基本ワークフローをご覧ください。

  1. 1Step 1

    サンプルの入手

    まず目的の凍結組織から始めます。対応するサンプルタイプには、マウス心臓、肝臓、脳、およびヒト腫瘍が含まれます。

    参考資料
  2. 2Step 2

    凍結サンプルの破砕

    付属の乳棒と溶解緩衝液を用いて、凍結組織を機械的に破砕し、均質な混合物にします。

    参考資料
  3. 3Step 3

    核の単離

    ホモジナイズした組織を付属のスピンカラムに通し、破砕したサンプルから核を単離します。

  4. 4Step 4

    デブリ除去

    付属のデブリ除去試薬と緩衝液洗浄を用いて、核懸濁液をクリーニングします。

  5. 5Step 5

    核の再懸濁とQC

    推奨される再懸濁緩衝液で核を再懸濁し、核の品質を確認した後、選択したシングルセルアッセイに進みます。

    参考資料

よくある質問

Chromium核抽出キットは、マウス心臓、肝臓、脳、肺、腎臓、小腸、および様々なヒト腫瘍の凍結組織で検証されています。テストされた組織の最新リストは、 10x Genomics Supportサポート サイトでご覧いただけます。本キットは、細胞懸濁液、植物または昆虫材料、石灰化組織、またはFFPE組織には対応しておりません。

サポートされる組織のサイズは、1カラムあたり3~50mgの範囲です。より大きな組織片については、組織を50mgの断片に分割し、複数の分離カラムを用いて、最終段階で核を集めます。3mg未満の断片を採取することも可能ですが、採取量は組織の種類によって異なります。

クリーンな核懸濁液を生成するために必要なすべての消耗品および試薬はキットに含まれており、標準的な実験器具を利用することができます。特殊な機器は必要ありません。

このキットは、ChromiumシングルセルATAC、シングルセルマルチオームATAC+遺伝子の発現、シングルセル遺伝子発現、および固定化RNAプロファイリングに対応しています。実行している特定のアッセイに関する核再懸濁の推奨事項に従ってください。シングルセルワークフローを変更する必要はありません。

10x Genomicsは、シングルセルデータの解析を行うソフトウェアを用意しています。対象のシングルセルアッセイに関する解析の推奨事項に従ってください。シングルセル遺伝子発現アッセイでは、解析中にイントロンが含まれていることをご確認ください。Cell RangerおよびLoupe Browserソフトウェアは、10x Genomicsサポートサイトから無料でダウンロードできます。

関連製品

Products

シングルセルATAC

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シングルセルマルチオームATAC + 遺伝子発現

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シングルセル遺伝子発現解析

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シングルセル遺伝子発現Flex

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Capabilities

  • オープンクロマチンによるエピゲノムプロファイリング
  • 同一核からの遺伝子発現とクロマチンプロファイリングの組み合わせ
  • 組織における3' 全トランスクリプトーム(遺伝子発現)
  • サンプルマルチプレックス
  • Whole transcriptome gene expression
  • サンプルマルチプレックス

Extensions

  • 細胞表面タンパク質
  • CRISPRスクリーニング
  • サンプルマルチプレックス
  • 細胞表面タンパク質
  • サンプルマルチプレックス

Instruments

  • Chromium X シリーズ
  • Chromium Controller
Single Cell Gene Expression

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