全トランスクリプトーム遺伝子発現解析において、サンプル調製の柔軟性がきわめて高く、スケジュールに沿ってサンプルの固定、バッチ処理およびランを行えます
次のような実験には、Flexをお勧めします
保存検体や品質の低いサンプルを使用
サンプルバッチ処理の柔軟性が必要
スケールアップの予定があり、細胞あたりのコストを低く抑える必要がある
3’遺伝子発現解析を行う多用途のソリューション（オプションでマルチオミック解析）
次のような実験には、3' 遺伝子発現をお勧めします
タンパク質同時発現の有無にかかわらず、全長トランスクリプトの情報が必要
遺伝子発現のみが必要。または将来的にATACを使用する可能性あり
必要細胞数が低い
5’遺伝子発現解析とマルチオミックプロファイリングとを組み合わせた免疫多様性の包括的解析
次のような実験には、5'遺伝子発現をお勧めします。
タンパク質同時発現の有無にかかわらず、全長トランスクリプトの情報が必要
今後、RISPRおよびTCR/BCRシーケンシングが必要になるか、選択肢に入るかもしれない
必要細胞数が低い
Primary capability
プローブベースの遺伝子発現予め設計したプローブ（オプションとしてカスタムプローブ）を用いた遺伝子発現解析
3' 遺伝子発現遺伝子3'末端付近のRNA分子を検出し定量
5'遺伝子発現遺伝子5'末端付近のRNA分子を検出し定量
Multiomic capabilities
細胞表面タンパク質表面タンパク質マーカーを特定することで、細胞型とバイオマーカーをピンポイントに分類し、細胞のシグナル伝達および相互作用を探索する
CRISPRスクリーニングシングルセルの解像度レベルで細胞sgRNAと遺伝子発現の変化を直接捕捉してCRISPR摂動の影響を評価
細胞内タンパク質核タンパク質、細胞質タンパク質、分泌タンパク質など、細胞全体のタンパク質の検出を実現
細胞表面タンパク質表面タンパク質マーカーを特定することで、細胞型とバイオマーカーをピンポイントに分類し、細胞のシグナル伝達および相互作用を探索する
細胞表面タンパク質表面タンパク質マーカーを特定することで、細胞型とバイオマーカーをピンポイントに分類し、細胞のシグナル伝達および相互作用を探索する
CRISPRスクリーニングシングルセルの解像度レベルで細胞sgRNAと遺伝子発現の変化を直接キャプチャーしてCRISPR摂動の影響を評価
BCR/TCRシーケンシング全長のB細胞・T細胞ペア型受容体をキャプチャーすることで、クローンの増殖および多様性に関する知見が得られる
抗原特異性適応免疫応答の詳細な特性を明らかにするために、免疫細胞受容体への抗原の結合を調べる
Compatible species
Compatible sample types
Resolution
全細胞/核Cells or nuclei are partitioned into GEM Gel Beads that uniquely barcode each, enabling single cell resolution
全細胞/核Cells or nuclei are partitioned into GEM Gel Beads that uniquely barcode each, enabling single cell resolution
全細胞/核Cells or nuclei are partitioned into GEM Gel Beads that uniquely barcode each, enabling single cell resolution
Run configuration options
Compatible instruments
Chromium iX、XChromium iXを用いて10x Genomicsのコアアッセイや技術をご利用になるか、Chromium Xを用いて10X Genomicsのシングルセルの全ポートフォリオをご活用ください
Chromium Xo、iX、 X低コストのXo装置を使用して3'遺伝子発現を実施するか、Chromium iXを用いて10x Genomicsのコアアッセイや技術をご利用になるか、Chromium Xを用いて10X Genomicsのシングルセルの全ポートフォリオをご活用ください
Chromium iX、XChromium iXを用いて10xGenomicsのコアアッセイや技術をご利用になるか、Chromium Xを用いて10X Genomicsのシングルセルの全ポートフォリオをご活用ください
Included data processing & analysis software
Included interactive visualization tools
Loupe BrowserLoupe BrowserはWindowsおよびMacOS用のデスクトップアプリケーションです。データをインタラクティブに視覚化できます
Loupe BrowserLoupe BrowserはWindowsおよびMacOS用のデスクトップアプリケーションです。データをインタラクティブに視覚化できます
Loupe BrowserInteractively explore clonotype information and repertoire diversity alongside gene expression data in Loupe Browser.
Loupe V(D)J BrowserInvestigate clonotypes and examine V(D)J transcripts with this interactive visualization desktop software.