Chromiumシングルセルの強力で多用途な機能を実際にご覧ください。世界中の研究者がどのようにして
Chromium シングルセルを活用し、新しい細胞タイプや状態を発見し、疾患のメカニズムを解明するなどの成果を上げているかをご紹介します。
遺伝子発現
逆転写ベースの遺伝子発現 (3’/5’)
幅広い生物種からの細胞タイプや状態を偏りなく特性評価するために、mRNA転写物の3'または5'末端をキャプチャーしてトランスクリプトーム全体をプロファイリングします。
対応サンプルタイプ
細胞懸濁液、核懸濁液、フローソート細胞、固定ヒトPBMC、新鮮組織、凍結組織、DSP/メタノール固定組織、オルガノイド
プローブベースの遺伝子発現
ヒトおよびマウスからの18,000以上の遺伝子を、全組織やFFPEサンプル、断片化されたRNAを含むサンプルからでも高感度かつ堅牢にプロファイリングします。
対応サンプルタイプ
細胞懸濁液、核懸濁液、フローソート細胞、固定全血、新鮮組織、凍結組織、FFPE組織、PFA固定組織、オルガノイド
クロマチンアクセシビリティ
クロマチンアクセシビリティ
細胞タイプ特異的な調節メカニズムをより深く理解するために、細胞ごとに数千のユニークなオープンクロマチン断片をゲノム全体で解析します。
対応サンプルタイプ
核懸濁液、新鮮組織、凍結組織
マルチオミックスプロファイリング
CRISPR
CRISPRによる編集やノックダウンと、それに伴う遺伝子発現のフェノタイプを直接評価することで、さまざまな細胞プロセスにおける遺伝子機能を評価します。
細胞表面タンパク質
同じ細胞から得られるタンパク質情報を追加することで、細胞のサブタイプや状態をより包括的に特性評価し、トランスクリプトミクスとプロテオミクスの関係を探ることができます。
細胞内タンパク質
核、細胞質、分泌タンパク質を含む細胞全体のタンパク質発現データを追加することで、異なる細胞表現型の理解を深めます。
T細胞受容体 / B細胞受容体
対応サンプルタイプT細胞および/またはB細胞のペアリードフルレングス受容体配列により、免疫系の包括的なビューを取得します。
ユニークなサンプル調製機能
凍結サンプルからの核分離
シングル核シーケンスのために凍結サンプルを簡単かつ効率的に調製し、実験プロセスを統合し、より多くのサンプルにアクセスできるようにします。
FFPEサンプルからの核分離
標準のChromium遺伝子発現Flexワークフローで使用するために、FFPE組織セクションから核を分離します。
全血の固定
Flexアッセイの前処理として全血から末梢血単核細胞(PBMC)および白血球を固定し、分離することで、より柔軟で便利な操作が可能になります。
ヒトPBMCの固定
RNAの完全性や壊れやすい細胞タイプを損なうことなく、ヒトPBMCサンプルを固定・保存し、スケジュールに合わせて3'または5'遺伝子発現解析を実施できます。
切断/固定
全組織から始め、小さく切断してから細胞懸濁液に分離する前に固定することで、他の分離方法では生存しない壊れやすい細胞を保存します。
追加の実験オプション
ロングリードシーケンス
Chromiumアッセイとロングリードシーケンスを組み合わせて、シングルセル解像度で代替アイソフォームとスプライシングを特定します。