Chromium单细胞分析

用途广泛的单细胞工具包

Chromium Single Cell
两种强大的化学方法可供选择

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概览
基因表达

通用型(3’/ 5’)

基于逆转录的全转录组覆盖

  • 广泛的多组学选择和多物种兼容性
  • 捕获异构体、长链非编码RNA等
  • 细胞回收率高,适合起始量低的样本
基因表达

Flex

基于探针的超过18,000个编码基因的检测

  • 分析以往无法使用的样本,包括固定组织和全血
  • 在FFPE样本和低质量样本上性能可靠
  • 超大规模和多重分析:多达256万个细胞/运行
产品
  • 通用型3’基因表达通用型3’基因表达
  • 通用型5’基因表达通用型5’基因表达
兼容物种
  • 不限不限
  • 人类人类
  • 小鼠小鼠
  • 其他物种(定制探针)其他物种(定制探针)
兼容样本
  • 细胞悬液细胞悬液
  • 细胞核悬液细胞核悬液
  • 流式分选的细胞流式分选的细胞
  • 固定的人类PBMC固定的人类PBMC
  • 新鲜组织新鲜组织
  • 冷冻组织冷冻组织
  • DSP/甲醇固定DSP/甲醇固定
  • 类器官类器官
  • 细胞悬液细胞悬液
  • 细胞核悬液细胞核悬液
  • 流式分选的细胞流式分选的细胞
  • 固定的全血固定的全血
  • 新鲜组织新鲜组织
  • 冷冻组织冷冻组织
  • FFPE组织FFPE组织
  • PFA固定组织PFA固定组织
  • 类器官类器官
多组学功能
  • 基因表达基因表达
  • TCR/BCR测序TCR/BCR测序
  • 抗原特异性抗原特异性
  • 细胞表面蛋白细胞表面蛋白
  • CRISPR筛选CRISPR筛选
  • 染色质可及性染色质可及性
  • 基因表达基因表达
  • 细胞表面蛋白细胞表面蛋白
  • 细胞内蛋白细胞内蛋白
  • CRISPR筛选CRISPR筛选
细胞和样本通量

从试点研究到中等规模的研究

单重分析
20,000个细胞/样本
160,000个细胞/芯片
8个样本/芯片
Hashing (散列)
8个通道/芯片
60,000个细胞/通道
480,000个细胞/芯片
产量:96+个样本/芯片

超高的可扩展性

单重分析
20,000个细胞/样本
160,000个细胞/芯片
8个样本/芯片
通道内多重分析
20,000个细胞/样本
2,560,000个细胞/芯片
多达16个样本/通道
产量:128个样本/芯片
Epigenetics icon
逐个细胞地揭示表观基因组景观
我们的Epi试剂盒以单细胞分辨率分析染色质可及性,利用全基因组表观遗传图谱解析细胞类型和状态,并深入了解基因调控机制。
Use fresh, frozen, or fixed samples—even FFPE samples

利用Multiome分析将同一个细胞核中的3’基因表达和表观基因组图谱直接关联

深入了解Epi Multiome
Use fresh, frozen, or fixed samples—even FFPE samples

分析每张芯片上多达80,000个细胞核(1 - 8个样本)

Use fresh, frozen, or fixed samples—even FFPE samples

多合一的分离试剂盒确保可靠的分析性能,且大多数组织几乎无需优化

深入了解细胞核分离试剂盒
比较我们广泛使用的单细胞产品
选择方法时需要帮助?
chromium single cell
GEM-X Flex基因表达
chromium single cell
GEM-X通用型3’基因表达
chromium single cell
GEM-X通用型5’基因表达
GEM-X Flex基因表达

全转录组基因表达分析产品,在样本制备方面拥有超高灵活性,能够按照您的日程表对样本进行固定、批量处理和运行

我们建议在以下实验中使用Flex……

  • 使用存档样本或质量较低的样本

  • 需要灵活的样本分批处理

  • 未来会扩大规模,且要求低的单细胞成本

Learn more了解Flex
Build an experiment
构建Flex实验
GEM-X通用型3’基因表达

多功能的解决方案,提供了3’基因表达分析,并附带多组学分析的选项

我们建议在以下实验中使用3’基因表达分析……

  • 需要全长转录本读数,需要或不需要蛋白质表达

  • 只需要基因表达,将来可能会使用ATAC

  • 对细胞起始量要求较低

GEM-X通用型5’基因表达

全面的免疫多样性分析,融合了5’基因表达和多组学分析

我们建议在以下实验中使用5’基因表达……

  • 需要全长转录本读数,需要或不需要蛋白质表达

  • 需要或将来可能会使用CRISPR和TCR/BCR测序

  • 对细胞起始量要求较低

Primary capability

基于探针的基因表达基于探针的基因表达

利用预先设计的探针分析基因表达,可选择增加定制探针

3’基因表达3’基因表达

检测和定量基因3’端附近的RNA分子

5’基因表达5’基因表达

检测和定量基因5’端附近的RNA分子

Multiomic capabilities

细胞表面蛋白细胞表面蛋白

鉴定表面蛋白标志物,以便对细胞类型进行分类,精确定位生物标志物,并探索细胞信号传导和相互作用

CRISPR筛选CRISPR筛选

通过细胞内sgRNA的直接捕获和基因表达的变化,以单细胞分辨率评估CRISPR扰动的影响

细胞内蛋白细胞内蛋白

对整个细胞内的蛋白质进行检测,包括核蛋白、胞质蛋白和分泌蛋白

细胞表面蛋白细胞表面蛋白

鉴定表面蛋白标志物,以便对细胞类型进行分类,精确定位生物标志物,并探索细胞信号传导和相互作用

细胞表面蛋白细胞表面蛋白

鉴定表面蛋白标志物,以便对细胞类型进行分类,精确定位生物标志物,并探索细胞信号传导和相互作用

CRISPR筛选CRISPR筛选

通过细胞内sgRNA的直接捕获和基因表达的变化,以单细胞分辨率评估CRISPR扰动的影响

TCR/BCR测序TCR/BCR测序

通过捕获配对的全长B细胞和T细胞受体,了解克隆扩增和多样性

抗原特异性抗原特异性

探究抗原与免疫细胞受体的结合,全面表征适应性免疫反应

Compatible species

人类
人类
小鼠
小鼠
其他物种
其他物种使用定制探针
Learn more
人类
人类
小鼠
小鼠
大鼠
大鼠
非人类灵长动物
非人类灵长动物
海洋生物
海洋生物
植物
植物
昆虫
昆虫
其他
其他
人类
人类
小鼠
小鼠
大鼠
大鼠TCR/BCR除外
非人类灵长动物
非人类灵长动物TCR/BCR除外
其他
其他

Compatible sample types

细胞悬液
细胞悬液
细胞核悬液
细胞核悬液
新鲜组织
新鲜组织
冷冻组织
冷冻组织
FFPE组织
FFPE组织
PFA固定组织
PFA固定组织
流式分选细胞
流式分选细胞
固定的全血
固定的全血
类器官
类器官
细胞悬液
细胞悬液
细胞核悬液
细胞核悬液
新鲜组织
新鲜组织
冷冻组织
冷冻组织
固定的人类PBMC
固定的人类PBMC
流式分选细胞
流式分选细胞
类器官
类器官
细胞悬液
细胞悬液
细胞核悬液
细胞核悬液
新鲜组织
新鲜组织
冷冻组织(仅限于基因表达)
冷冻组织(仅限于基因表达)
固定的人类PBMC
固定的人类PBMC
流式分选细胞
流式分选细胞
类器官
类器官

Resolution

整个细胞/细胞核整个细胞/细胞核

细胞或细胞核被分隔到带有独特条形码的GEM凝胶珠中,从而实现单细胞分辨率。

了解GEM-X 技术
整个细胞/细胞核整个细胞/细胞核

细胞或细胞核被分隔到带有独特条形码的GEM凝胶珠中,从而实现单细胞分辨率。

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整个细胞/细胞核整个细胞/细胞核

细胞或细胞核被分隔到带有独特条形码的GEM凝胶珠中,从而实现单细胞分辨率。

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Run configuration options

In-line multiplex
On-chip multiplexed
On-chip multiplexed

Compatible instruments

Chromium iX and XChromium iX and X

在iX上使用我们的核心产品和功能,或在Chromium X使用我们全线的单细胞产品组合。

探索Chromium X系列
Chromium Xo, iX, and XChromium Xo, iX, and X

在经济型Xo仪器上开展3’基因表达分析,在iX上使用我们的核心产品和功能,或在Chromium X上使用我们全线的单细胞产品组合。

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Chromium iX and XChromium iX and X

在iX上使用我们的核心产品和功能,或在Chromium X上使用我们全线的单细胞产品组合。

探索Chromium X系列

Included data processing & analysis software

Cell RangerCell Ranger

Cell Ranger是一套用于在本地处理Chromium单细胞数据的免费分析流程。

了解Cell Ranger
Cell RangerCell Ranger

Cell Ranger是一套用于在本地处理Chromium单细胞数据的免费分析流程。

了解Cell Ranger
Cell RangerCell Ranger

Cell Ranger是一套用于在本地处理Chromium单细胞数据的免费分析流程。

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Included interactive visualization tools

Loupe BrowserLoupe Browser

利用可视化工具 Loupe Browser 对 Chromium 单细胞基因表达数据进行可视化和解读,该工具可识别基因表达模式和细胞群。

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Loupe BrowserLoupe Browser

利用可视化工具 Loupe Browser 对 Chromium 单细胞基因表达数据进行可视化和解读,该工具可识别基因表达模式和细胞群。

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Loupe BrowserLoupe Browser

交互式探索Chromium单细胞染色质可及性数据,开展可及性差异分析,查找富含感兴趣基序的簇,并比较不同样本。

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Loupe V(D)J BrowserLoupe V(D)J Browser

使用此交互式可视化桌面软件,研究克隆型并分析 V(D)J 转录本。

下载Loupe V(D)J

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