Chromium GEM-X技术

为您的成功而打造的单细胞创新和流程

Chromium Technology
在流程的每一步自信地开展单细胞分析
无论您的经验如何,我们的工作流程专为您的成功而设计,从样本制备到直观分析。凭借业界领先的技术和深厚的专业知识,我们能够为更多的样本类型和应用提供高质量的可操作见解。
Chromium Single Cell workflow step 1
优化的样本制备,适合任何单细胞应用

利用专为您的成功而优化的样本制备方法,分析新鲜、冷冻和固定样本,甚至是FFPE样本。 我们广泛的产品组合提供 40多种示范方案 ,让您的单细胞研究比以往走得更远。

Chromium Technology tissue sample examples and a graphic of the Chromium X sample inputsChromium Technology tissue sample examples and a graphic of the Chromium X sample inputs
分析更多样本类型
  • 基于逆转录(RT)的通用型分析可以捕获广泛物种的数据
  • 基于探针的Flex分析可以将您的研究范围扩展到FFPE样本
  • 利用配套的试剂和统一的流程,从冷冻样本中轻松分离细胞核
通量灵活,轻松扩展
  • 每次运行可以处理1-128个样本,并对数百个至数百万个细胞进行分析,因此可以轻松地从试点研究转向大规模实验
  • 多重分析,提高效率
多重分析,提高效率
  • 对固定样本进行通道内多重分析,每次运行可以分析多达250万个细胞,实现样本批量处理
阅读下文,深入了解我们的多重分析技术
Chromium Single Cell workflow step 2
自动化的细胞微滴生成和添加条形码
十年的丰富经验和超过15亿美元的研发投资催生了GEM-X的先进微流控芯片架构以及Chromium X系列仪器的创新试剂输送系统。
Chromium Technology tissue sample examples and a graphic of the Chromium X sample inputs
GEM:Chromium单细胞技术的核心

在Chromium X系列仪器中,细胞在有限稀释后穿过通道,6分钟内可生成10,000多个纳米大小的GEM(Gel Beads-in-emulsion)。

每个GEM都是微反应的发生场所,其中凝胶珠被溶解,每个细胞的目标分子被捕获并添加条形码,以便对每个目标分子的来源细胞进行标记。

Chromium仪器的优势

您知道吗?Chromium X系列仪器可以自动完成单细胞分析中最关键的步骤:微滴生成和添加条形码。

这些快速高效的工作流程减少了费时费力的手动流程中常见的技术错误和批次效应。此外,这些仪器与GEM-X技术进步相结合,可实现业界领先的细胞捕获率(高达80%)和出色的重现性。

Chromium gel bead
利用更高质量的文库获取重要见解
经过优化的化学方法能够生成测序级的高质量文库,可用读数高达95%。
为期一天的实验室流程

从样本到可测序的文库仅需一天,而手动操作仅需3-4个小时。

将GEM产生的带有条形码的片段混合进行下游反应,构建与Illumina测序仪兼容的文库:

  • MiSeq
  • NextSeq 500/550/2000
  • HiSeq 2500 (快速运行)
  • HiSeq 3000/4000
  • NovaSeq 6000
测序更少,检测更多
GEM-X化学方法可确保高质量的结果,生成具有出色的复杂度和灵敏度的文库。这意味着您能够以较低的读取深度检测更多基因,还能改善复杂样本中稀有转录本和细胞类型的检测。
比其他方法高出40%以上的灵敏度
测序读数减少超过60%,降低了您的测序成本,帮助您最大限度地使用经费。
A graphic of strands of DNA
Graphic indicating step 3
探索数据并获得成果—无需生物信息学经验

没有生物信息学经验?没问题。我们的Cell Ranger和Loupe Browser组成了一个直观而强大的工具包,无论您是经验丰富的专家,还是第一次接触数据集,都可以对数据进行处理和可视化。

Screenshots of 10x Genomics Chromium softare
  • 使用Cell Ranger轻松解锁下游分析,这款简单易用的工作流程为单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据处理树立了新标准。
  • 借助互动式Loupe Browser对处理后的数据进行可视化,快速绘制您关注基因的差异表达。
  • 利用持续创新,体验自动细胞注释等新功能带来的便利。
多样化的化学方法支持各种起始样本、应用和规模
探索产品
基于逆转录(RT)的分析
捕获整个转录组以及多组学读数(蛋白质、CRISPR、BCR/TCR-seq或开放染色质)
Graphic of reverse transcription
为什么选择基于RT的通用型3’或5’分析?
  • 从各个物种中收集广泛的信息(异构体、单核苷酸多态性、长链非编码RNA等)
基于探针的分析
使用针对人类或小鼠的18,000多个编码基因的探针组对新鲜、冷冻和固定样本进行分析,并获得蛋白读数
Graphic of reverse transcription
为什么选择基于探针的Flex分析?
  • 三倍的靶点覆盖度带来高灵敏度和出色性能,适合FFPE和低质量样本
  • 利用目前最高的通量(在单张芯片上运行250万个细胞)开展大规模实验,降低每个细胞的成本
简化的多重分析助您灵活扩展并提高效率
基于探针的Flex分析的通道内多重分析和批量处理
在生成GEM之前,固定细胞悬液并与抗体多重分析条形码杂交,每个通道最多可混合16个样本
Graphic of reverse transcription
为什么选择Flex进行多重分析?
  • 批量处理和多重分析支持超大规模的研究,每次运行可处理1-128个样本和多达250万个细胞
  • 为您的实验流程带来便利,简化大规模项目和多中心研究
GEM-X技术的优势
更好的性能带来更高的成功率
Chart of GEM-X perhformace gains
Up to 2x
more genes
2x
more throughput
3x
faster run time
2x
lower multiplet rate
*此处列出的性能提升反映了3’ GEM-X分析(2024)相对于3’ Next-GEM分析(2018)的改进。
Icon of a sample in tube
更高效的GEM生成提高了脆弱细胞的捕获率,且不会增加细胞应激
Icon of data visulization chart
多细胞比例的降低带来更高的数据质量和稳定性
Icon of a Chromium X
通量更高,每个通道可捕获多达20,000个细胞,且每个细胞的成本降低50%
Icon of a Chromium X chip
改进芯片设计,减少堵塞,提高成功率
揭开生物学的全貌
为全转录组或靶向基因表达增添空间背景,扩展您的Chromium单细胞见解。

平台

Chromium单细胞分析

Chromium单细胞分析

See Chromium products
Visium空间分析

Visium空间分析

Xenium原位分析

Xenium原位分析

何时使用

Comprehensive single cell data

适用于细胞群体和状态的深度表征

High-resolution spatial gene expression

了解复杂组织、邻域和细胞间相互作用。与其他空间多组学、组织学和形态学方法整合。

为何使用

无偏的单细胞发现

每个基因的灵敏度高

无偏的空间发现

靶向的空间探索

每个基因的灵敏度高

应用

全转录组基因表达

蛋白质

TCR

BCR

CRISPR

ATAC

全转录组基因表达

靶向基因表达(多达5

000个基因)

分辨率

单细胞

分配在2-µm区域内的转录本

单细胞

数据读出

基于NGS

基于NGS

基于成像

样本兼容性

来自新鲜、冷冻或FFPE样本的单细胞或单细胞核悬液

FFPE样本

新鲜冷冻样本

FFPE样本