在单细胞分辨率上进行全转录组基因表达分析,并具有连续的组织覆盖率。
利用Visium CytAssist实现行业领先的转录本定位,来生成超高质量的空间转录组数据。
从人类或小鼠FFPE样本中生成强大的数据,包括存档的蜡块或预先切片的组织。
利用来自同一组织切片的高分辨率空间转录组学数据来提升对H&E和IF成像样本的分析。
新一代的玻片结构,实现单细胞分辨率
Visium HD空间基因表达玻片包含两个6.5 x 6.5 mm捕获区域,其中寡核苷酸连续排列在数百万个无间隙的2 x 2 µm条形码标记的正方形中,实现单细胞级的空间分辨率。数据以2 µm正方形单位以及多个合并的分析单位输出。 8 x 8 µm大小的分析单位是推荐的可视化和分析的起始点。
- 遵循标准的组织学操作流程,直接在载玻片上对组织进行切片、染色和成像
- 预筛选以找到最具生物学意义的组织切片
- 无需优化即可探索各种各样的FFPE组织
易于使用的可视化工具将组织学和基因表达数据无缝结合
探索组织背景中的基因表达簇
将数千个基因的表达映射到显微镜成像的H&E或IF图像上
识别邻近区域的基因特征
已证实的结果
视频
资源
Visium HD enables spatial discovery in FFPE human breast cancer at single-cell scale
Visium HD enables spatial discovery in FFPE human breast cancer at single-cell scale
Poster, 10x Genomics
Poster, 10x Genomics
Grant application resources for Visium Spatial products
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Grant Application Resources, 10x Genomics
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Whole transcriptome spatial discovery at the resolution you need
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Flyer, 10x Genomics
Flyer, 10x Genomics
常问问题
Visium HD空间基因表达玻片包含两个6.5 x 6.5 mm的捕获区域,其中寡核苷酸连续排列在数百万个无间隙的2 x 2 µm条形码标记的正方形中,实现单细胞级空间分辨率。
Visium HD与含有mRNA的人类和小鼠福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 组织切片兼容。这包括存档的FFPE蜡块和载玻片上的预先切片的组织。我们计划未来将样本扩展到其他组织条件。
Visium HD空间基因表达与用于形态学分析的苏木精和伊红 (H&E) 染色以及用于蛋白质共检测的免疫荧光 (IF) 染色兼容。
10x Genomics提供两种类型的软件来帮助您分析数据:Space Ranger和Loupe Browser。 Space Ranger是一款分析软件,可自动将空间基因表达信息叠加在组织图像上,并识别具有相似转录特征的条形码标记的方块簇。然后,您可以使用Loupe Browser(一种可视化软件)以交互方式探索结果。您可以从10x Genomics支持网站免费下载Space Ranger和Loupe Browser。