Chromiumシングルセル

Universal 5' 遺伝子発現

免疫多様性を解析するGEM-Xテクノロジーを用いたRTベースのアッセイ

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細胞回収率最大80%

高感度、ALT法に比べて40%以上高い遺伝子感受性

使いやすいリード、シーケンシングコストを最大50%節約

Universal 5' Gene Expressionを選択する理由

    全長トランスクリプトーム情報が必要
    サンプルあたり細胞500~20,000個という柔軟なスループット
    タンパク質、CRISPR、遺伝子発現、TCR/BCRなどの幅広いマルチオミックスオプション

アッセイの仕様

対応する生物種

マウス
ヒト
ラット(TCR/BCRを除く)
非ヒト霊長類(TCR/BCRを除く)
その他

対応するサンプルの種類

細胞懸濁液
核懸濁液
新鮮組織
凍結組織
FACSソート細胞
固定ヒトPBMC
オルガノイド

マルチオミックス機能

5'遺伝子発現
細胞表面タンパク質
BCR/TCRシーケンシング
CRISPRスクリーニング
抗原特異性

互換性のある装置

Chromium X

ラン構成

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シングルプレックス

2万細胞/サンプル
16万細胞/チップ
8サンプル/チップ

オンチップマルチプレックス

5,000細胞/サンプル
4万細胞/チップ
最大4サンプル/流路出力、8サンプル/チップ

アッセイ構成要素

個々の実験に必要なのは、チップ、インデックスキットおよびコア試薬ですが、オプションでバーコード化キットを使用できます。必要なものが不明な場合は、実験ビルダーをご使用ください。お客様の実験に必要な品目のリストを作成できます。

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Consumables

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Nuclei Isolation (optional)

REAGENT

1000494

Chromium Nuclei Isolation with RNase Inhibitor Kit, 16rxns

Chip

CHIP

1000748

Kit, GEM-X OCM 5' Chip Kit v3 4-plex, 2 chips

Index Kit

REAGENT

1000215

Dual Index Kit TT Set A 96 rxns

REAGENT

1000242

Dual Index Kit NT Set A, 96 rxn

Core Reagents

REAGENT

1000780

GEM-X Universal 5’ Gene Expression v3 4-plex, 16 samples

V(D)J Amplification Kit (optional)

REAGENT

1000252

Chromium Single Cell Human TCR Amplification Kit, 16 rxns

REAGENT

1000253

Chromium Single Cell Human BCR Amplification Kit, 16 rxns

REAGENT

1000254

Chromium Single Cell Mouse TCR Amplification Kit, 16 rxns

REAGENT

1000255

Chromium Single Cell Mouse BCR Amplification Kit, 16 rxns

REAGENT

1000694

Library Construction Kit C, 16 rxns

CRISPR Kit (optional)

REAGENT

1000451

5' CRISPR Kit, 16 rxns

Feature Barcoding Kit (optional)

REAGENT

1000703

Chromium GEM-X Single Cell 5 Feature Barcode Kit v3, 16 rxns

Compatible Instrument


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Product sheet

Sample prep

サンプル調製リソース

Sequencing requirements

最低20,000ペアリード/細胞で遺伝子発現解析。5,000ペアリード/細胞でV(D)J遺伝子再構成、タンパク質解析、CRISPR解析

シーケンシングのリソース

ビデオ

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10k Human DTC Melanoma, Chromium GEM-X Single Cell 5'

データセット

10k Human PBMCs Stained with TotalSeq™-C Human TBNK Cocktail, Chromium GEM-X Single Cell 5'

データセット

10k Mouse Splenocytes, Chromium GEM-X Single Cell 5'

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