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chromium
保存検体や品質の低いサンプルを使用
chromium
GEM-X Universal 3' 遺伝子発現
chromium
GEM-X Universal 5'遺伝子発現
保存検体や品質の低いサンプルを使用

全トランスクリプトーム遺伝子発現解析において、サンプル調製の柔軟性がきわめて高く、スケジュールに沿ってサンプルの固定、バッチ処理およびランを行えます

次のような実験には、Flexをお勧めします

  • 保存検体や品質の低いサンプルを使用

  • サンプルバッチ処理の柔軟性が必要

  • スケールアップの予定があり、細胞あたりのコストを低く抑える必要がある

詳細はこちらから
Build a Flex Experiment
GEM-X Universal 3' 遺伝子発現

3’遺伝子発現解析を行う多用途のソリューション(オプションでマルチオミック解析)

次のような実験には、3' 遺伝子発現をお勧めします

  • タンパク質同時発現の有無にかかわらず、全長トランスクリプトの情報が必要

  • 遺伝子発現のみが必要。または将来的にATACを使用する可能性あり

  • 必要細胞数が低い

GEM-X Universal 5'遺伝子発現

5’遺伝子発現解析とマルチオミックプロファイリングとを組み合わせた免疫多様性の包括的解析

次のような実験には、5'遺伝子発現をお勧めします。

  • タンパク質同時発現の有無にかかわらず、全長トランスクリプトの情報が必要

  • 今後、RISPRおよびTCR/BCRシーケンシングが必要になるか、選択肢に入るかもしれない

  • 必要細胞数が低い

Primary capability

プローブベースの遺伝子発現プローブベースの遺伝子発現

予め設計したプローブ(オプションとしてカスタムプローブ)を用いた遺伝子発現解析

3' 遺伝子発現3' 遺伝子発現

遺伝子3'末端付近のRNA分子を検出し定量

5'遺伝子発現5'遺伝子発現

遺伝子5'末端付近のRNA分子を検出し定量

Multiomic capabilities

細胞表面タンパク質細胞表面タンパク質

表面タンパク質マーカーを特定することで、細胞型とバイオマーカーをピンポイントに分類し、細胞のシグナル伝達および相互作用を探索する

CRISPRスクリーニングCRISPRスクリーニング

シングルセルの解像度レベルで細胞sgRNAと遺伝子発現の変化を直接捕捉してCRISPR摂動の影響を評価

細胞内タンパク質細胞内タンパク質

核タンパク質、細胞質タンパク質、分泌タンパク質など、細胞全体のタンパク質の検出を実現

細胞表面タンパク質細胞表面タンパク質

表面タンパク質マーカーを特定することで、細胞型とバイオマーカーをピンポイントに分類し、細胞のシグナル伝達および相互作用を探索する

細胞表面タンパク質細胞表面タンパク質

表面タンパク質マーカーを特定することで、細胞型とバイオマーカーをピンポイントに分類し、細胞のシグナル伝達および相互作用を探索する

CRISPRスクリーニングCRISPRスクリーニング

シングルセルの解像度レベルで細胞sgRNAと遺伝子発現の変化を直接キャプチャーしてCRISPR摂動の影響を評価

BCR/TCRシーケンシングBCR/TCRシーケンシング

全長のB細胞・T細胞ペア型受容体をキャプチャーすることで、クローンの増殖および多様性に関する知見が得られる

抗原特異性抗原特異性

適応免疫応答の詳細な特性を明らかにするために、免疫細胞受容体への抗原の結合を調べる

Compatible species

ヒト
ヒト
マウス
マウス
カスタムプローブで他の生物種に対応
カスタムプローブで他の生物種に対応
Learn more
ヒト
ヒト
マウス
マウス
ラット
ラット
非ヒト霊長類
非ヒト霊長類
海洋生物
海洋生物
植物
植物
昆虫
昆虫
その他
その他
ヒト
ヒト
マウス
マウス
非ヒト霊長類(TCR/BCRを除く)
非ヒト霊長類(TCR/BCRを除く)
ラット(TCR/BCRを除く)
ラット(TCR/BCRを除く)
その他
その他

Compatible sample types

細胞懸濁液
細胞懸濁液
核懸濁液
核懸濁液
新鮮組織
新鮮組織
凍結組織
凍結組織
FFPE組織
FFPE組織
PFA固定組織
PFA固定組織
FACSソート細胞
FACSソート細胞
固定全血
固定全血
オルガノイド
オルガノイド
細胞懸濁液
細胞懸濁液
核懸濁液
核懸濁液
新鮮組織
新鮮組織
凍結組織
凍結組織
固定ヒトPBMC
固定ヒトPBMC
FACSソート細胞
FACSソート細胞
オルガノイド
オルガノイド
細胞懸濁液
細胞懸濁液
核懸濁液
核懸濁液
新鮮組織
新鮮組織
凍結組織(遺伝子発現のみ)
凍結組織(遺伝子発現のみ)
固定ヒトPBMC
固定ヒトPBMC
FACSソート細胞
FACSソート細胞
オルガノイド
オルガノイド

Resolution

全細胞/核全細胞/核

Cells or nuclei are partitioned into GEM Gel Beads that uniquely barcode each, enabling single cell resolution

Learn about GEM-X Technology
全細胞/核全細胞/核

Cells or nuclei are partitioned into GEM Gel Beads that uniquely barcode each, enabling single cell resolution

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全細胞/核全細胞/核

Cells or nuclei are partitioned into GEM Gel Beads that uniquely barcode each, enabling single cell resolution

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Run configuration options

In-line multiplex
On-chip multiplexed
On-chip multiplexed

Compatible instruments

Chromium iX、XChromium iX、X

Chromium iXを用いて10x Genomicsのコアアッセイや技術をご利用になるか、Chromium Xを用いて10X Genomicsのシングルセルの全ポートフォリオをご活用ください

Discover the Chromium X Series
Chromium Xo、iX、 XChromium Xo、iX、 X

低コストのXo装置を使用して3'遺伝子発現を実施するか、Chromium iXを用いて10x Genomicsのコアアッセイや技術をご利用になるか、Chromium Xを用いて10X Genomicsのシングルセルの全ポートフォリオをご活用ください

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Chromium iX、XChromium iX、X

Chromium iXを用いて10xGenomicsのコアアッセイや技術をご利用になるか、Chromium Xを用いて10X Genomicsのシングルセルの全ポートフォリオをご活用ください

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Included data processing & analysis software

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Cell Rangerは、シングルセルデータをお客様が処理できるように無料で提供する解析パイプラインです

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迅速で簡単に結果が得られるように、最適化されたクラウドクラスター上で10xの解析パイプラインのランを実行するプラットフォーム

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Included interactive visualization tools

Loupe BrowserLoupe Browser

Loupe BrowserはWindowsおよびMacOS用のデスクトップアプリケーションです。データをインタラクティブに視覚化できます

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Interactively explore clonotype information and repertoire diversity alongside gene expression data in Loupe Browser.

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Investigate clonotypes and examine V(D)J transcripts with this interactive visualization desktop software.

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